More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1592 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1592  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
294 aa  547  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.942864  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6412  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.74 
 
 
297 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00524368  normal  0.397204 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4513  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  53.38 
 
 
297 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0726743  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3337  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  57.39 
 
 
297 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5035  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  54.65 
 
 
294 aa  265  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2433  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  55.52 
 
 
295 aa  255  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  45.02 
 
 
295 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206524  normal  0.0135112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1143  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.33 
 
 
295 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.99 
 
 
295 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.478459 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4274  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  43.64 
 
 
295 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347219  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21180  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.86 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.542348 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  42.81 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3196  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  44.4 
 
 
296 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1807  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  42.51 
 
 
296 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6400  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.4 
 
 
297 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1316  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.1 
 
 
296 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823499  normal  0.0105684 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1953  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.92 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1286  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.54 
 
 
297 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3270  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.46 
 
 
298 aa  176  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.6 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  38.6 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
294 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6125  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.8 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1977  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.34 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0142603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  37.89 
 
 
296 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5264  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.91 
 
 
287 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.764411  normal  0.268691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  39.93 
 
 
303 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  37.89 
 
 
296 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3607  tartronate semialdehyde reductase  37.89 
 
 
296 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  0.959534 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  37.89 
 
 
296 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3510  tartronate semialdehyde reductase  37.89 
 
 
296 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.900889  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5161  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  41.99 
 
 
297 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  39.22 
 
 
303 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2821  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  37.06 
 
 
289 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0845  tartronate semialdehyde reductase  38.95 
 
 
294 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.89 
 
 
300 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.03 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.03 
 
 
297 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.03 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2076  oxidoreductase  44.17 
 
 
315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.68 
 
 
297 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.93 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.68 
 
 
292 aa  162  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3567  tartronate semialdehyde reductase  37.19 
 
 
296 aa  161  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.795052 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.49 
 
 
307 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.49 
 
 
306 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2316  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  34.76 
 
 
355 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.16521 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.43 
 
 
294 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.75 
 
 
294 aa  160  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  33.68 
 
 
296 aa  160  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3393  tartronate semialdehyde reductase  37.54 
 
 
294 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0811  tartronate semialdehyde reductase  38.6 
 
 
294 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.43 
 
 
300 aa  159  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5720  oxidoredutase  45.08 
 
 
290 aa  158  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3283  transmembrane 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase oxidoreductase protein  38.97 
 
 
303 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  38.75 
 
 
290 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.54 
 
 
297 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3038  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.64 
 
 
295 aa  157  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.24 
 
 
304 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1704  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.79 
 
 
308 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.59 
 
 
304 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.62 
 
 
291 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0693  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding protein  40.38 
 
 
305 aa  155  7e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.682361  normal  0.0958689 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.46 
 
 
283 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2417  hypothetical protein  42.4 
 
 
295 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2375  hypothetical protein  42.4 
 
 
312 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.870155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0245  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.71 
 
 
304 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1923  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.71 
 
 
296 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1940  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  42.4 
 
 
297 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.300274  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.49 
 
 
292 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2701  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.68 
 
 
292 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.68 
 
 
296 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0722  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.43 
 
 
296 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1523  putative dehydrogenase  41.49 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.041306  normal  0.892116 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.5 
 
 
294 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0485372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  37.68 
 
 
296 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4729  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  43.62 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0958  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.74 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1712  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.29 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.032164  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6528  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.11 
 
 
297 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.186276  normal  0.100696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2927  tartronate semialdehyde reductase  39.58 
 
 
299 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.378474 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.88 
 
 
297 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.81 
 
 
296 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3553  tartronate semialdehyde reductase  37.19 
 
 
294 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1394  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.5 
 
 
296 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125188  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3351  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.86 
 
 
303 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561404  hitchhiker  0.00525216 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0957  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.52 
 
 
305 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.46 
 
 
303 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6206  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.49 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107985  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.84 
 
 
284 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.07 
 
 
292 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0975  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.83 
 
 
299 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.247687  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0699  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  34.77 
 
 
286 aa  149  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000621245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2233  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.64 
 
 
294 aa  149  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>