More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2433 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2433  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  100 
 
 
295 aa  584  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4513  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  69.28 
 
 
297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0726743  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6412  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  69.97 
 
 
297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00524368  normal  0.397204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3337  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  63.95 
 
 
297 aa  348  5e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5035  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  50.92 
 
 
294 aa  260  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1592  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  55.52 
 
 
294 aa  215  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.942864  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3270  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  41.11 
 
 
298 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1251  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  38.11 
 
 
298 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3196  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  38.11 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6400  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.78 
 
 
297 aa  171  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1570  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.44 
 
 
297 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.101448  normal  0.880113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4299  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.08 
 
 
297 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3864  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.08 
 
 
297 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0721878  normal  0.335239 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2369  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.21 
 
 
292 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3379  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.89 
 
 
291 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0410434 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5161  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  39.29 
 
 
297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1160  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  37.19 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.206524  normal  0.0135112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3624  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.38 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1173  tartronate semialdehyde reductase  36.24 
 
 
296 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3126  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.08 
 
 
300 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3343  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  37.46 
 
 
303 aa  162  9e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.81 
 
 
294 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5561  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.1 
 
 
283 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.560852  normal  0.0590725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1143  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.49 
 
 
295 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200546 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0081  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.21 
 
 
292 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.280871 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3990  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  37.46 
 
 
303 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1177  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.14 
 
 
295 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.383553  normal  0.478459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5347  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding protein  40.7 
 
 
305 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21180  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.04 
 
 
296 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.542348 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5436  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  40.7 
 
 
305 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4274  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  35.86 
 
 
295 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.347219  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5726  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  40.35 
 
 
305 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45020  putative oxidoreductase  38.97 
 
 
296 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.820061  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3831  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.97 
 
 
296 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1286  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.74 
 
 
297 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.648289  normal  0.934383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0261  6-phosphogluconate dehydrogenase NAD-binding  37.68 
 
 
305 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0646517 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1807  putative 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  36.04 
 
 
296 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3480  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.31 
 
 
304 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2161  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase  34.74 
 
 
299 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3153  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.31 
 
 
304 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3094  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.49 
 
 
303 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0518605 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3450  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.92 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2614  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.94 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3294  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.54 
 
 
286 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.738468  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1933  oxidoreductase protein  36.59 
 
 
290 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.508408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3293  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.91 
 
 
306 aa  149  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2771  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.98 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0891841  normal  0.489794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3283  transmembrane 2-hydroxy-3-oxopropionate reductase oxidoreductase protein  37.67 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1712  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.26 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.032164  normal  0.768061 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3038  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.79 
 
 
295 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6206  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.19 
 
 
293 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.107985  normal  0.646779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1316  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.59 
 
 
296 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823499  normal  0.0105684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08160  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.62 
 
 
298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4563  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.25 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92371  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0566  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.94 
 
 
292 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2487  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  40.14 
 
 
288 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0573  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.94 
 
 
292 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0568  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.94 
 
 
292 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1704  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.55 
 
 
308 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.542696  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4859  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.38 
 
 
297 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.748222  normal  0.158599 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3351  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.62 
 
 
303 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561404  hitchhiker  0.00525216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0627  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.94 
 
 
292 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2547  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.6 
 
 
294 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0672659  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.28 
 
 
294 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.167544  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4310  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.56 
 
 
294 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0860064 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1953  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.19 
 
 
297 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3089  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.27 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1159  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  39.79 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0245  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  38.03 
 
 
304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02990  tartronate semialdehyde reductase  34.18 
 
 
296 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0580  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.18 
 
 
296 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0575  tartronate semialdehyde reductase  34.18 
 
 
296 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02941  hypothetical protein  34.18 
 
 
296 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4437  tartronate semialdehyde reductase  34.18 
 
 
294 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.211957 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1632  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.56 
 
 
303 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3420  tartronate semialdehyde reductase  34.18 
 
 
294 aa  140  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3314  tartronate semialdehyde reductase  34.18 
 
 
294 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3603  tartronate semialdehyde reductase  34.18 
 
 
294 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3233  tartronate semialdehyde reductase  34.18 
 
 
294 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43420  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.97 
 
 
296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.164862  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2462  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.28 
 
 
302 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394551  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3742  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.27 
 
 
303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3690  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.46 
 
 
292 aa  139  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3760  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.68 
 
 
293 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814396  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0594  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.17 
 
 
299 aa  139  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.84188  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2119  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  36.04 
 
 
304 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0276919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0460  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  35.56 
 
 
294 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0485372  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0236  6-phosphogluconate dehydrogenase, NAD-binding  35.29 
 
 
284 aa  137  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355607  normal  0.156106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2852  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  33.68 
 
 
297 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00459  tartronate semialdehyde reductase, NADH-dependent  34.16 
 
 
292 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3103  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.16 
 
 
292 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3546  tartronate semialdehyde reductase  33.45 
 
 
296 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.370176  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0546  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.16 
 
 
292 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0610  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.52 
 
 
292 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00464  hypothetical protein  34.16 
 
 
292 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3441  tartronate semialdehyde reductase  33.45 
 
 
296 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1297  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.15 
 
 
294 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3113  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  34.16 
 
 
292 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.327741 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3438  tartronate semialdehyde reductase  33.45 
 
 
296 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1600  2-hydroxy-3-oxopropionate reductase  37.19 
 
 
293 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.36162  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>