50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3121 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  50.25 
 
 
205 aa  206  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  43.65 
 
 
199 aa  161  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  40.3 
 
 
205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  36.82 
 
 
190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  29.05 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  24.54 
 
 
209 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  39.47 
 
 
131 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  21.83 
 
 
193 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  40.26 
 
 
131 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  24.74 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  24.74 
 
 
199 aa  55.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  27.27 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  35.38 
 
 
120 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  32.03 
 
 
133 aa  51.6  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  38.98 
 
 
139 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  36.51 
 
 
122 aa  49.3  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  33.9 
 
 
120 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  34.88 
 
 
122 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  27.22 
 
 
195 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  30.77 
 
 
120 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  30.84 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  39.06 
 
 
159 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  24.02 
 
 
206 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  28.79 
 
 
120 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  32.81 
 
 
150 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  39.06 
 
 
151 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  28.57 
 
 
128 aa  45.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3375  hypothetical protein  30.77 
 
 
119 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  26.27 
 
 
144 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  30.14 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  33.87 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  37.1 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  32.35 
 
 
135 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  30.14 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  31.82 
 
 
130 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  30.56 
 
 
129 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  32.2 
 
 
142 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  34.72 
 
 
118 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  36.67 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  32.35 
 
 
142 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  35.29 
 
 
130 aa  42.4  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  37.1 
 
 
129 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  35.85 
 
 
194 aa  42  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  42  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  31.58 
 
 
198 aa  41.6  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  35.38 
 
 
113 aa  41.6  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  28.92 
 
 
124 aa  41.2  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>