25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0041 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  70.39 
 
 		 208 aa  303  8.000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  39.22 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  36.93 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  32.8 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  36 
 
 		 193 aa  118  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  31.25 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  31.25 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  35.56 
 
 		 202 aa  96.3  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  28.99 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  34.86 
 
 		 133 aa  80.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  32.96 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2916  hypothetical protein  46.55 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  29.89 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  26.01 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  47.27 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  32.05 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  41.54 
 
 		 148 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  24.02 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  40.35 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  38.18 
 
 		 104 aa  43.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  40.35 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  38.89 
 
 		 168 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  35.94 
 
 		 162 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>