29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0330 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0164  hypothetical protein  43.37 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2321  Domain of unknown function DUF1905  45.45 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  33.11 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  36.07 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  31.88 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1648  hypothetical protein  39.02 
 
 		 93 aa  63.5  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  30.97 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  30.91 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  23.23 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  40.32 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  28.1 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  28.08 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2238  Domain of unknown function DUF1905  38.57 
 
 		 105 aa  47.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  39.06 
 
 		 206 aa  47.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  26.4 
 
 		 168 aa  43.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2973  hypothetical protein  24.26 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3117  hypothetical protein  25.87 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1855  hypothetical protein  27.62 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160181  hitchhiker  0.00411591 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2490  hypothetical protein  40.68 
 
 		 217 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000483036  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2743  hypothetical protein  38.98 
 
 		 217 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00154883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2733  hypothetical protein  38.98 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2729  hypothetical protein  38.98 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000111062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2716  hypothetical protein  38.98 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.635961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2455  hypothetical protein  38.98 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2530  hypothetical protein  38.98 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.470515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>