20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2380 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  319  8e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  49.03 
 
 		 162 aa  150  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  43.36 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  36.88 
 
 		 171 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2906  hypothetical protein  34.29 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157084 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2238  Domain of unknown function DUF1905  46.25 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5574  hypothetical protein  29.29 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  30.66 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  28.89 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  26.45 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  31.86 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4086  Domain of unknown function DUF1905  46.77 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5932  hypothetical protein  36 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0433317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  27.12 
 
 		 197 aa  42  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  31.25 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  25.83 
 
 		 160 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0164  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>