11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2113 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  326  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  58.97 
 
 		 162 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1855  hypothetical protein  51.88 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160181  hitchhiker  0.00411591 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0088  hypothetical protein  51.88 
 
 		 162 aa  163  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  27.54 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  27.68 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  26.92 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  28.26 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  28.24 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  32.86 
 
 		 205 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  25.83 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>