37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3162 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  43.72 
 
 		 205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  40.3 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  39.39 
 
 		 199 aa  131  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  37.19 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  32.96 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  28.21 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  28.74 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  27.32 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  25.51 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  23.64 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  24.16 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  24.16 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  23.95 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  41.1 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  38.1 
 
 		 120 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  23.89 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  40.98 
 
 		 148 aa  48.1  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  36.67 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  43.4 
 
 		 101 aa  45.8  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  32.86 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  31.86 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  37.29 
 
 		 162 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  31.94 
 
 		 131 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3375  hypothetical protein  40.43 
 
 		 119 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  31.75 
 
 		 120 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  33.9 
 
 		 120 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  30.7 
 
 		 141 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0088  hypothetical protein  34.85 
 
 		 162 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  31.88 
 
 		 144 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  37.74 
 
 		 104 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  25.24 
 
 		 133 aa  41.6  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  41.2  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>