66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4835 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  267  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  70.45 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  67.42 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  69.92 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  62.2 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  75.89 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  70.94 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  66.67 
 
 		 150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  64.8 
 
 		 301 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  68.38 
 
 		 118 aa  167  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  65.25 
 
 		 133 aa  166  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  64.29 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  64.75 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  62.99 
 
 		 396 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  60.31 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  62.2 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  62.2 
 
 		 154 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  62.2 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  62.2 
 
 		 141 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  61.42 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  61.42 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  59.26 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  60.32 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  64.04 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  61.54 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  58.06 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  58.27 
 
 		 150 aa  150  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  55.56 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  59.17 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  59.17 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  59.17 
 
 		 144 aa  144  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  61.4 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  58.62 
 
 		 145 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  55.65 
 
 		 147 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  55.56 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  55.65 
 
 		 147 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  55.65 
 
 		 147 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  56.9 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  51.75 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  50.41 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  53.04 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  48.76 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  50.91 
 
 		 126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  50.91 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  50.91 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  48.18 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  35.09 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  36.28 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  53.57 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  56.25 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  31.9 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  75.86 
 
 		 40 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  36.36 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  30.36 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  30.14 
 
 		 206 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  29.63 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  30.36 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  30.28 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  28.44 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  30.77 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  30 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  27.66 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  27 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  30.36 
 
 		 182 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>