34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4645 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  427  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  50.25 
 
 
206 aa  206  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  47.29 
 
 
199 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  43.72 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  36.23 
 
 
190 aa  134  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  29.76 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  28.65 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  25.89 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  26.14 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  38.81 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  21.83 
 
 
193 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  42.19 
 
 
151 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  26.01 
 
 
206 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  26.15 
 
 
133 aa  53.9  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  28.07 
 
 
195 aa  50.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  36.71 
 
 
135 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  32.53 
 
 
131 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  31.65 
 
 
131 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  36.36 
 
 
120 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  34.33 
 
 
120 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  36.76 
 
 
129 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  25.71 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  25.71 
 
 
199 aa  45.1  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  34.33 
 
 
120 aa  45.1  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  29.63 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  29.63 
 
 
131 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  39.34 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  35.59 
 
 
118 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  32.97 
 
 
148 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  21.65 
 
 
208 aa  43.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  36.36 
 
 
177 aa  41.6  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  32.31 
 
 
149 aa  41.2  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>