19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1217 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  70.39 
 
 
206 aa  303  8.000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  39.5 
 
 
209 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  37.5 
 
 
192 aa  124  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  35.56 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  33.15 
 
 
193 aa  111  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  32.2 
 
 
199 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  32.2 
 
 
199 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  35.36 
 
 
202 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  27.57 
 
 
195 aa  81.3  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  28.74 
 
 
205 aa  71.6  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  28.7 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2916  hypothetical protein  48.39 
 
 
72 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  43.75 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  31.17 
 
 
148 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  22.84 
 
 
199 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  21.65 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  36.36 
 
 
104 aa  42  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3667  flagellar biosynthetic protein FlhB  34.18 
 
 
376 aa  41.6  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>