44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0870 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  401  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  47.29 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  43.65 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  40.82 
 
 		 190 aa  134  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  39.39 
 
 		 205 aa  131  5e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  29.35 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  25.64 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  25.64 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  26 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  22.96 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  23.88 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  25.12 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  40.32 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  29.89 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  25.27 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0402  hypothetical protein  42.62 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0412  hypothetical protein  42.62 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0259051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  44.26 
 
 		 151 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  32.91 
 
 		 162 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  47.17 
 
 		 163 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  40.32 
 
 		 120 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  41.67 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  41.67 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1268  hypothetical protein  40.91 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  36.76 
 
 		 120 aa  48.1  0.00008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  38.1 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  43.55 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  34.78 
 
 		 131 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  36.67 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  42 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  40.62 
 
 		 129 aa  45.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  43.1 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  37.5 
 
 		 104 aa  44.7  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  33.93 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4952  hypothetical protein  35 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0639865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  42.37 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  36.51 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  22.84 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  37.88 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  44.44 
 
 		 118 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  37.5 
 
 		 120 aa  42.4  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  36.67 
 
 		 113 aa  42  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  36.67 
 
 		 149 aa  41.6  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>