28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6138 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  393  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  59.9 
 
 		 193 aa  249  1e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  56.77 
 
 		 193 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  44.39 
 
 		 209 aa  187  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  45.83 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  45.83 
 
 		 199 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  53.54 
 
 		 133 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  36.93 
 
 		 206 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 208 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  34.87 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  38.02 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2916  hypothetical protein  59.42 
 
 		 72 aa  90.9  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  28.65 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  28.21 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2033  hypothetical protein  45.9 
 
 		 69 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000693714  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  22.96 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  30.09 
 
 		 144 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  30.38 
 
 		 163 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  34.57 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  30.09 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  30.7 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  29.2 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  34.48 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  27.27 
 
 		 131 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  34.62 
 
 		 118 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  35 
 
 		 193 aa  42  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  32.04 
 
 		 141 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>