56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8805 on replicon NC_011893
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  98.61 
 
 
144 aa  285  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  96.53 
 
 
144 aa  258  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  74.24 
 
 
145 aa  206  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  63.97 
 
 
155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  71.2 
 
 
142 aa  178  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  69.05 
 
 
141 aa  178  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  65.41 
 
 
132 aa  176  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  64.89 
 
 
150 aa  173  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  59.85 
 
 
134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  63.28 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  64.29 
 
 
301 aa  170  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  70.25 
 
 
141 aa  167  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  62.99 
 
 
139 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  66.94 
 
 
133 aa  164  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  60.77 
 
 
146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  60.77 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  60.77 
 
 
154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  63.41 
 
 
136 aa  162  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  58.33 
 
 
396 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  60.77 
 
 
154 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  60.94 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  60 
 
 
154 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  60 
 
 
146 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  63.11 
 
 
118 aa  157  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  61.24 
 
 
133 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  56.62 
 
 
150 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  56.62 
 
 
150 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  60.98 
 
 
130 aa  151  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  54.96 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  58.4 
 
 
131 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  58.4 
 
 
131 aa  147  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  61.74 
 
 
135 aa  144  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  54.26 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  54.63 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  52.29 
 
 
126 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  52.29 
 
 
126 aa  123  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  52.29 
 
 
126 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  52.46 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  50.41 
 
 
145 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  48.06 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  48.06 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  48.06 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  46.67 
 
 
146 aa  107  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  45.9 
 
 
144 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  45.83 
 
 
146 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  62.5 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  33.87 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  75.86 
 
 
40 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  47.27 
 
 
57 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  24.59 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  29.91 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  30.09 
 
 
192 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  29.11 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>