70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0970 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  239  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  69.49 
 
 
132 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  71.55 
 
 
155 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  75.44 
 
 
140 aa  185  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  70.69 
 
 
150 aa  184  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  69.49 
 
 
132 aa  184  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  72.41 
 
 
141 aa  183  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  67.52 
 
 
396 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  69.23 
 
 
133 aa  177  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  70.09 
 
 
141 aa  177  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  70.18 
 
 
146 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  70.18 
 
 
154 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  70.18 
 
 
154 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  70.18 
 
 
154 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  69.3 
 
 
154 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  69.3 
 
 
146 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  67.8 
 
 
142 aa  173  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  65.22 
 
 
130 aa  173  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  62.71 
 
 
134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  67.24 
 
 
133 aa  170  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  67.86 
 
 
139 aa  169  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  68.38 
 
 
131 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  68.38 
 
 
131 aa  167  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  65.25 
 
 
145 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  70.75 
 
 
135 aa  161  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  63.93 
 
 
136 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  66.07 
 
 
150 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  64.29 
 
 
150 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  62.71 
 
 
132 aa  159  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  63.87 
 
 
301 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  63.11 
 
 
144 aa  157  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  63.93 
 
 
144 aa  156  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  63.93 
 
 
144 aa  155  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  58.04 
 
 
140 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  55.56 
 
 
145 aa  133  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  52.99 
 
 
133 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  54.7 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  52.99 
 
 
147 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  52.99 
 
 
147 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  53.85 
 
 
146 aa  124  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  52.99 
 
 
147 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  52.14 
 
 
146 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  51.28 
 
 
144 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  52.78 
 
 
113 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  51.38 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  51.38 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  51.38 
 
 
126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  70.83 
 
 
65 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  27.93 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  62.79 
 
 
57 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  35.92 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  30.33 
 
 
124 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  75.86 
 
 
40 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  26.55 
 
 
131 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  31.86 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  31.86 
 
 
147 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  34.21 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  31.86 
 
 
152 aa  47.4  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  34.72 
 
 
206 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3351  hypothetical protein  29.2 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  30.77 
 
 
156 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  28.7 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2299  hypothetical protein  29.2 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  34.62 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4223  hypothetical protein  30.38 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279869  hitchhiker  0.00388236 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  31.09 
 
 
193 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  30.97 
 
 
182 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  28.72 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2642  hypothetical protein  32.39 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  32.1 
 
 
205 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>