52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3304 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  293  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  97.26 
 
 		 146 aa  286  6e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  81.63 
 
 		 147 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  81.63 
 
 		 147 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  81.63 
 
 		 147 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  80.82 
 
 		 144 aa  237  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  77.86 
 
 		 145 aa  219  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  69.63 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  59.12 
 
 		 133 aa  164  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  46.56 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  51.2 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  48.06 
 
 		 133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  53.51 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  47.73 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  50.81 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  52.63 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  50.37 
 
 		 154 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  50 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  50 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  52.14 
 
 		 118 aa  123  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  46.04 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  47.11 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  45.16 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  47.15 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  52.5 
 
 		 301 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  50.88 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  48.76 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  48.76 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  48.55 
 
 		 154 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  48.55 
 
 		 146 aa  120  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  44.37 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  49.17 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  43.18 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  51.75 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  48.36 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  46.77 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  49.57 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  44.83 
 
 		 133 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  45.83 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  45 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  47.22 
 
 		 132 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  41.28 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  39.09 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  39.09 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  39.09 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  29.82 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  27.19 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  52.08 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  46.15 
 
 		 40 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3613  hypothetical protein  31.82 
 
 		 97 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>