56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1807 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  279  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  68.18 
 
 
132 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  70.31 
 
 
155 aa  201  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  73.11 
 
 
150 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  63.64 
 
 
132 aa  192  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  66.94 
 
 
141 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  64.29 
 
 
142 aa  186  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  70.09 
 
 
141 aa  185  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  60.47 
 
 
133 aa  181  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  69.3 
 
 
154 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  64.52 
 
 
154 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  69.3 
 
 
154 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  60.31 
 
 
396 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  69.3 
 
 
146 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  68.42 
 
 
154 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  68.42 
 
 
146 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  61.9 
 
 
139 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  62.2 
 
 
131 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  65.04 
 
 
145 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  62.2 
 
 
131 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  63.2 
 
 
136 aa  173  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  61.24 
 
 
133 aa  173  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  58.02 
 
 
301 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  62.71 
 
 
118 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  62.3 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  62.93 
 
 
150 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  57.36 
 
 
140 aa  167  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  56.82 
 
 
132 aa  167  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  62.07 
 
 
150 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  62.1 
 
 
144 aa  164  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  61.29 
 
 
144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  61.29 
 
 
144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  61.95 
 
 
135 aa  155  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  54.1 
 
 
145 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  56.03 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  50.41 
 
 
133 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  46.56 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  48.06 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  48.06 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  48.06 
 
 
147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  49.59 
 
 
144 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  45.8 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  46.88 
 
 
145 aa  130  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  50.46 
 
 
113 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  49.55 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  49.55 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  49.55 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  33.06 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  31.3 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  57.45 
 
 
65 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  52.83 
 
 
57 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  72.41 
 
 
40 aa  47.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  27.43 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  28.1 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  35.29 
 
 
133 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  25.45 
 
 
138 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>