60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0935 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  274  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  70.99 
 
 
131 aa  198  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  36.28 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  36.28 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  33.06 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  30 
 
 
145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  29.73 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  31.86 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  30.36 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  28.83 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  28.32 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  30.63 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  28.7 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  28.7 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  29.73 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  28.7 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  28.7 
 
 
154 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  28.7 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  28.07 
 
 
146 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  28.7 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  29.27 
 
 
141 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  31.3 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  31.86 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  27.97 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  27.19 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  30.51 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  28.07 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  40.26 
 
 
206 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  30.89 
 
 
113 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  27.93 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  31.86 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  27.73 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  27.73 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  27.43 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  28.33 
 
 
396 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  28.44 
 
 
126 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  28.44 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  28.44 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  28.07 
 
 
136 aa  50.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  39.13 
 
 
120 aa  50.8  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  34.67 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  27.93 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  32.53 
 
 
205 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  26.55 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  28.07 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  33.33 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  28.57 
 
 
135 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  29 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  43.55 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  37.14 
 
 
190 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  24.79 
 
 
144 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  24.79 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  24.79 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  31.34 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  30.67 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>