53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4440 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  86.9 
 
 
144 aa  254  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  81.63 
 
 
146 aa  239  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  81.63 
 
 
146 aa  239  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  77.08 
 
 
145 aa  224  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  74.45 
 
 
145 aa  206  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  63.16 
 
 
133 aa  173  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  48.06 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  53.72 
 
 
150 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  51.64 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  52.89 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  54.62 
 
 
141 aa  131  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  52.89 
 
 
140 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  49.18 
 
 
132 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  51.24 
 
 
139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  53.28 
 
 
130 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  52.34 
 
 
301 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  51.16 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  55.65 
 
 
131 aa  127  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  49.61 
 
 
150 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  55.65 
 
 
131 aa  127  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  49.22 
 
 
155 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  51.61 
 
 
396 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  51.69 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  50.78 
 
 
145 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  52.99 
 
 
118 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  47.29 
 
 
132 aa  124  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  48.18 
 
 
146 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  48.18 
 
 
154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  48.18 
 
 
154 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  47.45 
 
 
154 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  48.8 
 
 
146 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  48.8 
 
 
154 aa  120  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  48.31 
 
 
133 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  49.57 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  48.33 
 
 
144 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  48.33 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  47.5 
 
 
144 aa  107  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  51.92 
 
 
132 aa  106  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  43.12 
 
 
113 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  40.91 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  40.91 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  40.91 
 
 
126 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  28.07 
 
 
131 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  28.57 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  58.33 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0288  hypothetical protein  26.27 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  47.5 
 
 
40 aa  41.6  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3613  hypothetical protein  30.3 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>