61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3985 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  82.54 
 
 		 139 aa  219  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  70 
 
 		 396 aa  198  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  67.67 
 
 		 132 aa  191  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  66.44 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  66.44 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  66.44 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  66.44 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  65.96 
 
 		 154 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  65.96 
 
 		 146 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  72.88 
 
 		 118 aa  186  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  68.5 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  63.64 
 
 		 132 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  66.41 
 
 		 150 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  61.36 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  63.16 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  66.67 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  68.64 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  68.91 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  68.07 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  65.12 
 
 		 145 aa  169  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  56.82 
 
 		 134 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  66.39 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  69.83 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  62.02 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  64.29 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  64.29 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  62.68 
 
 		 301 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  67.77 
 
 		 136 aa  165  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  60.8 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  62.1 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  61.29 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  62.1 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  65.22 
 
 		 140 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  55.47 
 
 		 133 aa  144  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  55.65 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  50.77 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  50.77 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  50.77 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  49.63 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  50 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  48.89 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  52.85 
 
 		 145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  52.34 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  50.88 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  50.88 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  50.88 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  72.92 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  32.46 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  56.14 
 
 		 57 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  28.07 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  29.36 
 
 		 124 aa  50.4  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  68.97 
 
 		 40 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  29.84 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  31.3 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  31.62 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  30.08 
 
 		 193 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  29.81 
 
 		 119 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  30.09 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  31.62 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.471467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>