20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4979 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  100 
 
 
124 aa  249  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3613  hypothetical protein  38.16 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  30.33 
 
 
118 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  25.4 
 
 
133 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  30.48 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  29.66 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  29.25 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  39.29 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  28.1 
 
 
141 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  27.42 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  32.35 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  27.93 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  31 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  29.57 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  30.85 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4223  hypothetical protein  29.46 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.279869  hitchhiker  0.00388236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  31.25 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  27.36 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  30 
 
 
121 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>