54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3467 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  270  7e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  63.16 
 
 
147 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  63.16 
 
 
147 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  63.16 
 
 
147 aa  173  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  62.32 
 
 
145 aa  173  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  60.58 
 
 
144 aa  169  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  64.96 
 
 
145 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  59.12 
 
 
146 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  59.12 
 
 
146 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  56.67 
 
 
150 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  58.77 
 
 
140 aa  141  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  56.03 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  55 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  55 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  51.64 
 
 
132 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  50.41 
 
 
134 aa  136  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  51.13 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  52.38 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  53.91 
 
 
396 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  52.99 
 
 
118 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  53.51 
 
 
133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  52.99 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  51.18 
 
 
154 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  51.75 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  51.75 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  51.18 
 
 
146 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  51.18 
 
 
154 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  51.18 
 
 
154 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  48.48 
 
 
133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  49.18 
 
 
132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  49.61 
 
 
301 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  51.28 
 
 
141 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  50.39 
 
 
154 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  50.39 
 
 
146 aa  122  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  49.59 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  51.72 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  52.46 
 
 
144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  48.78 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  53.28 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  52.46 
 
 
144 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  52.29 
 
 
135 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  49.21 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  39.81 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  37.04 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  34.21 
 
 
131 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  36.11 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  36.11 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  54.17 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4979  Domain of unknown function DUF1801  25.4 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  34.57 
 
 
192 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  30.09 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  47.62 
 
 
57 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>