55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2351 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  73.91 
 
 		 133 aa  188  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  66.92 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  68.33 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  68.6 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  70.43 
 
 		 132 aa  179  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  72.97 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  65.67 
 
 		 142 aa  177  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  65.22 
 
 		 118 aa  173  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  64.66 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  67.83 
 
 		 141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  62.3 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  60 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  63.03 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  63.48 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  63.48 
 
 		 154 aa  167  6e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  63.48 
 
 		 146 aa  167  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  60 
 
 		 154 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  59.2 
 
 		 154 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  60.8 
 
 		 140 aa  164  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  62.61 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  63.11 
 
 		 136 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  61.79 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  66.37 
 
 		 135 aa  160  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  58.4 
 
 		 396 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  64.04 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  64.04 
 
 		 131 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  59.35 
 
 		 150 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  57.89 
 
 		 301 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  57.26 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  62.5 
 
 		 144 aa  150  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  61.67 
 
 		 144 aa  148  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  61.67 
 
 		 144 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  55.17 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  54.1 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  53.28 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  53.28 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  53.28 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  54.17 
 
 		 145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  52.99 
 
 		 133 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  53.15 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  52.63 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  50.88 
 
 		 146 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  49.09 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  48.15 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  48.15 
 
 		 126 aa  113  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  48.15 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  66.67 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  31.36 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  27.93 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  75.86 
 
 		 40 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  35.29 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  31.18 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  30.53 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>