58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4111 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  72.73 
 
 
132 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  68.18 
 
 
134 aa  202  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  72.18 
 
 
150 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  74.19 
 
 
155 aa  199  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  75.2 
 
 
133 aa  197  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  76.92 
 
 
141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  67.18 
 
 
396 aa  191  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  73.33 
 
 
141 aa  188  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  67.46 
 
 
139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  68.75 
 
 
154 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  68.75 
 
 
154 aa  187  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  68.75 
 
 
146 aa  187  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  68.75 
 
 
154 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  67.46 
 
 
142 aa  186  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  67.42 
 
 
131 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  67.42 
 
 
131 aa  185  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  67.97 
 
 
146 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  69.49 
 
 
118 aa  185  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  67.97 
 
 
154 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  66.4 
 
 
133 aa  184  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  64.84 
 
 
140 aa  180  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  70.43 
 
 
130 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  70.73 
 
 
145 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  71.3 
 
 
150 aa  176  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  61.03 
 
 
136 aa  174  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  61.76 
 
 
301 aa  173  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  66.67 
 
 
150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  65.32 
 
 
132 aa  171  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  67.74 
 
 
144 aa  169  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  67.74 
 
 
144 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  67.74 
 
 
144 aa  167  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  67.86 
 
 
135 aa  164  5e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  61.21 
 
 
140 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  51.64 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  51.67 
 
 
145 aa  135  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  49.18 
 
 
147 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  49.18 
 
 
147 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  49.18 
 
 
147 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  49.18 
 
 
145 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  47.54 
 
 
144 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  45.97 
 
 
146 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  45.16 
 
 
146 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  51.35 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  51.35 
 
 
126 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  51.35 
 
 
126 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  50.46 
 
 
113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  32.74 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  62.5 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  28.32 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  50.88 
 
 
57 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  82.76 
 
 
40 aa  51.6  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  31.36 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  30.58 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  31.15 
 
 
193 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  30.58 
 
 
147 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  29.31 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>