44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5464 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  100 
 
 
193 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  57.51 
 
 
193 aa  247  6e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  56.77 
 
 
192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  43.69 
 
 
209 aa  190  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  44.56 
 
 
199 aa  184  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  44.56 
 
 
199 aa  184  7e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  62.3 
 
 
133 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  39.18 
 
 
202 aa  138  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  40.54 
 
 
195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  35.56 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  36 
 
 
206 aa  118  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2916  hypothetical protein  65.71 
 
 
72 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  27.32 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2033  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  67.8  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000693714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  25.89 
 
 
205 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  27.04 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  26 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  27.27 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  31.9 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  31.9 
 
 
131 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  33.61 
 
 
132 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  34.17 
 
 
133 aa  52  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  36.28 
 
 
150 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  33.33 
 
 
396 aa  48.5  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  34.43 
 
 
144 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  33.61 
 
 
144 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  33.61 
 
 
144 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  30.83 
 
 
154 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  31.2 
 
 
145 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  30.83 
 
 
154 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  45.1  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  31.15 
 
 
132 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  28.81 
 
 
131 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  32.43 
 
 
139 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  28.81 
 
 
154 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  43.48 
 
 
163 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  33.63 
 
 
155 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  30.56 
 
 
135 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  34.57 
 
 
136 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  31.09 
 
 
118 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>