34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1973 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  387  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  36.23 
 
 
205 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  40.82 
 
 
199 aa  134  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  36.82 
 
 
206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  37.19 
 
 
205 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  27.09 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  26.13 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  26.86 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  26.86 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  27.04 
 
 
193 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  33.73 
 
 
120 aa  52  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0898  hypothetical protein  26.25 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  38.57 
 
 
139 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  43.86 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  34.21 
 
 
126 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  42.42 
 
 
118 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2204  hypothetical protein  22.09 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  32.05 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  34.85 
 
 
120 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  28.81 
 
 
120 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  36.07 
 
 
129 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  34.78 
 
 
131 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  36.23 
 
 
122 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  34.43 
 
 
120 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  37.14 
 
 
131 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  44.7  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  37.5 
 
 
177 aa  42.4  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  42.31 
 
 
197 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  38.71 
 
 
148 aa  42  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  30.88 
 
 
124 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  34.38 
 
 
150 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  35.59 
 
 
162 aa  41.2  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104538 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>