55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8593 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  288  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  97.92 
 
 
144 aa  261  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  96.53 
 
 
144 aa  258  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  78.69 
 
 
145 aa  202  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  69.05 
 
 
141 aa  180  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  66.15 
 
 
155 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  65.41 
 
 
132 aa  174  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  69.6 
 
 
142 aa  173  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  61.81 
 
 
150 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  61.15 
 
 
301 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  63.28 
 
 
132 aa  169  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  59.09 
 
 
134 aa  168  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  63.78 
 
 
139 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  66.94 
 
 
133 aa  163  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  59.09 
 
 
396 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  61.54 
 
 
146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  61.54 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  61.54 
 
 
154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  67.77 
 
 
141 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  61.72 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  61.54 
 
 
154 aa  160  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  62.6 
 
 
136 aa  160  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  60.77 
 
 
154 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  60.77 
 
 
146 aa  159  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  63.93 
 
 
118 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  61.24 
 
 
133 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  55.73 
 
 
132 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  60.16 
 
 
130 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  52.78 
 
 
150 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  52.78 
 
 
150 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  58.4 
 
 
131 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  58.4 
 
 
131 aa  147  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  56.72 
 
 
135 aa  144  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  53.49 
 
 
140 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  54.63 
 
 
113 aa  129  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  52.29 
 
 
126 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  52.29 
 
 
126 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  52.29 
 
 
126 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  52.46 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  49.59 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  47.29 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  47.29 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  47.29 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  49.18 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  45.83 
 
 
146 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  45.08 
 
 
144 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  45 
 
 
146 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  60.42 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  30 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  33.87 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  49.09 
 
 
57 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  72.41 
 
 
40 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  30.09 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  24.79 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  29.06 
 
 
152 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>