42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0733 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  100 
 
 
40 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  86.21 
 
 
132 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  82.76 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  79.31 
 
 
150 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  82.76 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  82.76 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  75.86 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  69.44 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  82.76 
 
 
132 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  75.86 
 
 
301 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  79.31 
 
 
155 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  82.14 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  75.86 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  75.86 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  75.86 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  75.86 
 
 
144 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  75.86 
 
 
130 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  68.97 
 
 
140 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  72.41 
 
 
134 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  68.97 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  68.97 
 
 
154 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  72.41 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  68.97 
 
 
396 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  68.97 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  65.52 
 
 
135 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  68.97 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  68.97 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  68.97 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  65.52 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  68.97 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  62.07 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  48.72 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  62.07 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  62.07 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  47.5 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  47.5 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  47.5 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  55.17 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  62.07 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  62.07 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  46.15 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  46.15 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.63153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>