60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0329 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.919804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  75.2 
 
 		 132 aa  197  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  70.23 
 
 		 132 aa  191  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  73.6 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0625  hypothetical protein  64.89 
 
 		 146 aa  191  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.538203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0841  hypothetical protein  64.89 
 
 		 154 aa  190  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1807  hypothetical protein  64.89 
 
 		 154 aa  190  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  78.45 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  70.08 
 
 		 150 aa  189  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  67.74 
 
 		 396 aa  189  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1146  hypothetical protein  64.89 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961698  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2351  hypothetical protein  73.91 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373683  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1061  hypothetical protein  64.12 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2358  hypothetical protein  64.12 
 
 		 146 aa  188  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  66.93 
 
 		 155 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  68.8 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3352  hypothetical protein  67.21 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  60.47 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  72.65 
 
 		 135 aa  180  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  67.18 
 
 		 141 aa  180  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  69.92 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  69.92 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  69.23 
 
 		 118 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  65.04 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  70.49 
 
 		 145 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  66.92 
 
 		 301 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  66.13 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  70.43 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  68.7 
 
 		 150 aa  165  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8805  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8593  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6118  hypothetical protein  66.67 
 
 		 144 aa  160  6e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  59.52 
 
 		 132 aa  157  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  66.09 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7189  hypothetical protein  54.17 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3820  hypothetical protein  49.61 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.252087 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3601  hypothetical protein  51.16 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3927  hypothetical protein  51.16 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.28727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4440  hypothetical protein  51.16 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3304  hypothetical protein  48.06 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.63153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3467  hypothetical protein  53.51 
 
 		 133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00321907  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4656  hypothetical protein  55.17 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2159  hypothetical protein  50.82 
 
 		 144 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  50.46 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  48.65 
 
 		 126 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  47.75 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  47.75 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  33.93 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2858  hypothetical protein  66.67 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0243407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  31.86 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2857  hypothetical protein  58.82 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00803614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0733  hypothetical protein  69.44 
 
 		 40 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5464  hypothetical protein  34.17 
 
 		 193 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0310358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  33.08 
 
 		 205 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  31.86 
 
 		 205 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  35.87 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  27.03 
 
 		 202 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  25.62 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  29.82 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>