33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2747 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  296  5e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  95.92 
 
 
147 aa  288  1e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  78.29 
 
 
182 aa  218  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  70.29 
 
 
301 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2624  hypothetical protein  66.15 
 
 
143 aa  185  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650658  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  60.27 
 
 
152 aa  183  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  63.5 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2299  hypothetical protein  64.84 
 
 
156 aa  176  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3351  hypothetical protein  61.72 
 
 
140 aa  176  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  63.57 
 
 
152 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2528  hypothetical protein  53.38 
 
 
138 aa  154  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  54.93 
 
 
138 aa  153  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  55.71 
 
 
144 aa  152  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2514  hypothetical protein  38.41 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  32.5 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  32.2 
 
 
145 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  31.86 
 
 
118 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03067  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.642359  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4111  hypothetical protein  30.58 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  32.63 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  30.97 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  30.36 
 
 
131 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  28.91 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  28.91 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2915  hypothetical protein  22.88 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.334284 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  28.95 
 
 
141 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  29.82 
 
 
142 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1765  hypothetical protein  29.82 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  30.77 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  27.68 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0329  hypothetical protein  29.82 
 
 
133 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.919804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>