26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1158 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  294  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3351  hypothetical protein  71.43 
 
 
140 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2624  hypothetical protein  68.12 
 
 
143 aa  191  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650658  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  64.79 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  64.79 
 
 
152 aa  186  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2299  hypothetical protein  63.24 
 
 
156 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2528  hypothetical protein  64.66 
 
 
138 aa  179  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  59.06 
 
 
152 aa  177  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  62.5 
 
 
301 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  52.11 
 
 
138 aa  157  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  57.69 
 
 
182 aa  156  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  57.14 
 
 
147 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  55.71 
 
 
147 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2514  hypothetical protein  37.61 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  34.21 
 
 
118 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  26.27 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  28.7 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  27.48 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  27.64 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  31.88 
 
 
205 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  27.34 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2626  hypothetical protein  28.93 
 
 
142 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.896818  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1159  hypothetical protein  32.39 
 
 
135 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  29.07 
 
 
150 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>