15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2528 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2528  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2624  hypothetical protein  71.01 
 
 
143 aa  201  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650658  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  67.39 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  67.88 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2299  hypothetical protein  69.17 
 
 
156 aa  193  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3351  hypothetical protein  66.67 
 
 
140 aa  191  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  65.94 
 
 
156 aa  190  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  64.66 
 
 
144 aa  179  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  62.31 
 
 
301 aa  175  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  55.64 
 
 
138 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  55.04 
 
 
182 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  53.38 
 
 
147 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  56.35 
 
 
147 aa  153  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2514  hypothetical protein  35.04 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  28.18 
 
 
131 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>