32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2066 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  323  7e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2299  hypothetical protein  81.41 
 
 
156 aa  270  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2624  hypothetical protein  77.86 
 
 
143 aa  228  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650658  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3351  hypothetical protein  73.48 
 
 
140 aa  216  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  72.18 
 
 
301 aa  215  2e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  71.83 
 
 
152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  65.82 
 
 
152 aa  208  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  68.42 
 
 
182 aa  193  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2528  hypothetical protein  65.94 
 
 
138 aa  190  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  61.48 
 
 
138 aa  187  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  64.79 
 
 
144 aa  187  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  63.5 
 
 
147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  63.5 
 
 
147 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2514  hypothetical protein  35.65 
 
 
156 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  30.77 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2065  hypothetical protein  30.97 
 
 
150 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  27.73 
 
 
155 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3758  hypothetical protein  28.44 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  30.28 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4835  hypothetical protein  28.44 
 
 
131 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0530  hypothetical protein  25.21 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  28.8 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  29.77 
 
 
150 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4506  hypothetical protein  29.46 
 
 
141 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.633488 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3985  hypothetical protein  31.62 
 
 
140 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  27.48 
 
 
132 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5136  hypothetical protein  29.57 
 
 
136 aa  42  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745133  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  26.85 
 
 
126 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  26.85 
 
 
126 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1212  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.407451  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  26.85 
 
 
126 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>