29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3840 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3840  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  283  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.384787  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2066  hypothetical protein  61.48 
 
 
156 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1062  hypothetical protein  66.15 
 
 
301 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2299  hypothetical protein  60.61 
 
 
156 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3351  hypothetical protein  60 
 
 
140 aa  180  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2624  hypothetical protein  59.7 
 
 
143 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650658  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4505  hypothetical protein  58.78 
 
 
152 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.471467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0628  hypothetical protein  56.12 
 
 
152 aa  167  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2528  hypothetical protein  55.64 
 
 
138 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1158  hypothetical protein  52.11 
 
 
144 aa  157  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2747  hypothetical protein  54.93 
 
 
147 aa  153  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3195  hypothetical protein  53.85 
 
 
182 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2653  hypothetical protein  53.9 
 
 
147 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.179816  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2514  hypothetical protein  31.75 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  28.97 
 
 
131 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4172  hypothetical protein  26.85 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.96777  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4096  hypothetical protein  26.85 
 
 
126 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4327  hypothetical protein  26.85 
 
 
126 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.012726  normal  0.0625635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  29 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2738  hypothetical protein  27.55 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000274922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2751  hypothetical protein  22.4 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2656  hypothetical protein  21.6 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4622  hypothetical protein  25.47 
 
 
113 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0627  hypothetical protein  30.19 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2298  hypothetical protein  27.61 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.879582 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  26.21 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1381  hypothetical protein  30 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1623  hypothetical protein  26.8 
 
 
396 aa  40.4  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  25.45 
 
 
134 aa  40  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>