32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1235 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  243  6e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  80.67 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  74.17 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  62.39 
 
 		 124 aa  146  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  57.85 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  55.17 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  56.52 
 
 		 126 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  52.25 
 
 		 142 aa  126  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  50.82 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  55.05 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  50.93 
 
 		 113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  47.01 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  43.81 
 
 		 139 aa  103  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  44.66 
 
 		 129 aa  98.2  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  38.33 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  38.53 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  37.14 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  28.83 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  27.45 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  35.38 
 
 		 206 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  31.58 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  34.67 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  38.1 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  34.85 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  28.46 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  31.68 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2672  hypothetical protein  27.27 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3221  hypothetical protein  26.92 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  33.9 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>