34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1020 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  243  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  80.67 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  79.83 
 
 		 120 aa  198  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  57.14 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  59.48 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  53.51 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  58.72 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  52.34 
 
 		 142 aa  127  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  53.7 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  50.88 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  50.47 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  44.23 
 
 		 129 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  44.35 
 
 		 128 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  44.76 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  43.97 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  36.67 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  39.09 
 
 		 114 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  34.29 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  27.52 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  26.83 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3221  hypothetical protein  30.48 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  24.77 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  30.77 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  36.76 
 
 		 199 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  34.43 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  31.75 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09788  hypothetical protein  27.48 
 
 		 151 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.130728  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  30.85 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  45.83 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3375  hypothetical protein  28.3 
 
 		 119 aa  40  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>