26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1109 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  255  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  66.67 
 
 
124 aa  156  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  58.33 
 
 
120 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  60.91 
 
 
113 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  61.4 
 
 
122 aa  140  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  58.18 
 
 
129 aa  139  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  56.52 
 
 
120 aa  136  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  57.02 
 
 
120 aa  136  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  58.72 
 
 
120 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  53.39 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  56.48 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  50.86 
 
 
122 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  43.59 
 
 
129 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  47.79 
 
 
139 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  44.17 
 
 
128 aa  101  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  42.24 
 
 
128 aa  93.6  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  40.52 
 
 
124 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  37.82 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  39.62 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  31.37 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  28.7 
 
 
120 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  34.21 
 
 
190 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3221  hypothetical protein  28.85 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  26.42 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  29.47 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>