22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5314 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  258  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  58.06 
 
 
128 aa  133  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  46.09 
 
 
129 aa  110  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  44.55 
 
 
122 aa  99  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  43.8 
 
 
142 aa  98.2  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  43.97 
 
 
120 aa  97.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  41.8 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  44.74 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  43.59 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  42.24 
 
 
126 aa  93.6  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  45.45 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  40.52 
 
 
120 aa  89.7  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  43.12 
 
 
120 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  41.28 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  42.59 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  34.51 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  37.5 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  33.07 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  37.27 
 
 
111 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  29.82 
 
 
120 aa  60.8  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  29.46 
 
 
114 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0531  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.257553  normal  0.992847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>