25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1426 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  286  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  52.38 
 
 
129 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  59.26 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  54.46 
 
 
122 aa  135  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  55.14 
 
 
120 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  54.21 
 
 
120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  53.39 
 
 
126 aa  127  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  52.34 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  52.25 
 
 
120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  54.21 
 
 
113 aa  120  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  47.01 
 
 
122 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  53.21 
 
 
113 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  45.38 
 
 
128 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  44.44 
 
 
139 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  43.8 
 
 
128 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  38.52 
 
 
129 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  35.71 
 
 
124 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  38.53 
 
 
111 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  31.09 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  31.43 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  31.19 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  35.85 
 
 
120 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  37.66 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  36.67 
 
 
199 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>