25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1789 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  266  8.999999999999999e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  37.82 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  36.21 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  36.04 
 
 
113 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  31.86 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  33.07 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  30.63 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  30.77 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  33.61 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  32.74 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  33.05 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  32.8 
 
 
120 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  35.59 
 
 
120 aa  60.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  34.26 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  28.18 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  30.63 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  28.83 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  29.73 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  29.51 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  35.29 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  29.36 
 
 
202 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  37.1 
 
 
206 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  33.82 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  35.21 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>