28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_26260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  235  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  34.86 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  33.94 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  33.94 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  33.64 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  31.37 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  33.03 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  28.7 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  30.39 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  35.51 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  37.38 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  31.37 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  34.83 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  27.52 
 
 		 120 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  27.45 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  36.26 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  27.18 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  28.83 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  26.92 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  42.42 
 
 		 190 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  35.29 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  35.59 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  44.44 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  31.25 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2394  hypothetical protein  36.76 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000734889  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  37.29 
 
 		 206 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1024  Domain of unknown function DUF1801  35.71 
 
 		 152 aa  40  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187798  normal  0.287584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>