24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2780 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  235  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  61.06 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  62.04 
 
 		 129 aa  147  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  60.91 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  64.81 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  57.27 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  54.13 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  53.7 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  55.05 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  50.91 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  51.38 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  54.21 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  50.88 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  47 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  44.14 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  43.36 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  43.24 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  36.04 
 
 		 114 aa  79.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  31.86 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  28.7 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  29.73 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  37.84 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3221  hypothetical protein  25.49 
 
 		 110 aa  43.5  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>