20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2321 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  227  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  43.36 
 
 
113 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  39.81 
 
 
129 aa  84.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  39.25 
 
 
122 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  39.62 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  38.89 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  39.81 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  38.53 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  35.24 
 
 
120 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  37.14 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  34.29 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  35.19 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  33.93 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  37.27 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  35.78 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  35.92 
 
 
129 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  29.09 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  34.83 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  29.52 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  28.83 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>