23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4173 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  262  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  58.06 
 
 
128 aa  133  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  44.53 
 
 
129 aa  119  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  42.28 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  47.01 
 
 
120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  44.35 
 
 
120 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  45.38 
 
 
142 aa  106  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  44.17 
 
 
126 aa  101  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  41.74 
 
 
120 aa  100  6e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  44.14 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  41.44 
 
 
120 aa  97.4  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  42.98 
 
 
124 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  43.64 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  37.61 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  37.82 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  36.63 
 
 
129 aa  80.5  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  36.11 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  33.93 
 
 
111 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  31.53 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  28.18 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  26.92 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  23.01 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>