31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1960 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  246  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  63.48 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  59.65 
 
 		 124 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  62.28 
 
 		 122 aa  149  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  58.33 
 
 		 126 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  57.85 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  57.14 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  57.85 
 
 		 120 aa  143  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  57.27 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  54.05 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  55.14 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  51.38 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  52.29 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  45 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  41.44 
 
 		 128 aa  97.4  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  40.71 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  43.12 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  31.48 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  32.8 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  33.03 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  31.09 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  38.1 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  33.73 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  40.32 
 
 		 199 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  34.62 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  33.9 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  34.33 
 
 		 205 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  32.97 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  42  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>