16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0480 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  250  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  80 
 
 
121 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  78.63 
 
 
119 aa  190  7e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  76.92 
 
 
119 aa  189  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  46.49 
 
 
121 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  44.74 
 
 
121 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  44.74 
 
 
121 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  43.1 
 
 
151 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  44.64 
 
 
130 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3882  hypothetical protein  46.15 
 
 
112 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0370234  normal  0.0307082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  37.62 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  36.56 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  31.37 
 
 
210 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2625  hypothetical protein  39.06 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939105  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1807  hypothetical protein  27.43 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  35.48 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>