39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1907 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1482  hypothetical protein  71.26 
 
 
89 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131633  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1540  hypothetical protein  69.77 
 
 
86 aa  141  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216845  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2443  hypothetical protein  68.24 
 
 
85 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0875175  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37320  hypothetical protein  63.41 
 
 
84 aa  119  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.346472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2282  hypothetical protein  58.24 
 
 
92 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2667  hypothetical protein  62.32 
 
 
92 aa  99  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00681101  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3358  hypothetical protein  62.32 
 
 
78 aa  99  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.044934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7108  hypothetical protein  58.54 
 
 
86 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2416  hypothetical protein  55.7 
 
 
80 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000121553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4068  hypothetical protein  61.84 
 
 
78 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20456  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2408  hypothetical protein  54.76 
 
 
83 aa  95.9  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140352  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0476  hypothetical protein  58.02 
 
 
80 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1414  hypothetical protein  53.16 
 
 
77 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000150753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5792  hypothetical protein  55.7 
 
 
84 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1004  hypothetical protein  60.61 
 
 
79 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146583  decreased coverage  0.00213317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1868  hypothetical protein  54.43 
 
 
84 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0840588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1888  hypothetical protein  54.43 
 
 
84 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0219416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1934  hypothetical protein  54.43 
 
 
84 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1038  hypothetical protein  53.16 
 
 
84 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4367  hypothetical protein  50.7 
 
 
93 aa  82.4  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330462  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1820  hypothetical protein  55.41 
 
 
78 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0959  hypothetical protein  59.65 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.818056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1020  hypothetical protein  59.65 
 
 
79 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1017  hypothetical protein  59.65 
 
 
79 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00426574  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2830  hypothetical protein  44.32 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398906  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  32.76 
 
 
119 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  34.48 
 
 
119 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  32.76 
 
 
121 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  31.9 
 
 
119 aa  58.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  33.77 
 
 
121 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1803  hypothetical protein  36.73 
 
 
133 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.986795  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  32.47 
 
 
121 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  33.33 
 
 
106 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  28.87 
 
 
126 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  31.17 
 
 
151 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  32.1 
 
 
121 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2625  hypothetical protein  38.1 
 
 
109 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.939105  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  34.29 
 
 
130 aa  44.7  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>