12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3882 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3882  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  234  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0370234  normal  0.0307082 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1913  hypothetical protein  56.84 
 
 
121 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000103196  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1586  hypothetical protein  50.51 
 
 
121 aa  103  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1946  hypothetical protein  55.79 
 
 
121 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000249775  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2380  hypothetical protein  55.79 
 
 
121 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000201201  normal  0.45808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1939  hypothetical protein  55.79 
 
 
151 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00181312  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1691  hypothetical protein  49.45 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2457  hypothetical protein  49.45 
 
 
119 aa  90.9  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0662521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0480  hypothetical protein  46.15 
 
 
119 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1906  hypothetical protein  45.16 
 
 
126 aa  87.4  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4161  hypothetical protein  48 
 
 
130 aa  84.7  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0571  hypothetical protein  36.25 
 
 
106 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>