20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2642 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2642  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  300  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1024  Domain of unknown function DUF1801  72.18 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187798  normal  0.287584 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2394  hypothetical protein  65.41 
 
 
157 aa  188  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000734889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8844  hypothetical protein  55.17 
 
 
146 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1178  hypothetical protein  61.11 
 
 
128 aa  162  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3434  hypothetical protein  56 
 
 
156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0744496  normal  0.059661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2079  Domain of unknown function DUF1801  53.74 
 
 
150 aa  155  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0297995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0555  hypothetical protein  54.35 
 
 
156 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1217  hypothetical protein  54.35 
 
 
153 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.889377  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3371  hypothetical protein  45.81 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0511  hypothetical protein  46.72 
 
 
141 aa  127  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2173  hypothetical protein  46.1 
 
 
161 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.294686  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0788  hypothetical protein  45.39 
 
 
180 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571735  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4098  hypothetical protein  44.67 
 
 
160 aa  121  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.369529  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2344  hypothetical protein  43.36 
 
 
160 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612858  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2458  Domain of unknown function DUF1801  30.66 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0934396  hitchhiker  0.00000261825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22220  protein of unknown function (DU1801)  34.56 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3419  hypothetical protein  32.14 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19540  protein of unknown function (DU1801)  37.97 
 
 
132 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275996  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0970  hypothetical protein  32.39 
 
 
118 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.710124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>