42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0865 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  304  4.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  46.26 
 
 		 150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  39.86 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  38.73 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  44.36 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  32.19 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  30.2 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1855  hypothetical protein  29.45 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.160181  hitchhiker  0.00411591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  29.63 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  32 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  27.54 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  41.1 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4645  hypothetical protein  42.19 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  44.26 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  26.06 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3091  hypothetical protein  39.29 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  39.29 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  27.72 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  37.93 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  39.34 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1423  hypothetical protein  35.71 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4100  hypothetical protein  47.54 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0708804  normal  0.708257 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4212  hypothetical protein  47.54 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0088  hypothetical protein  24.64 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  39.06 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5010  hypothetical protein  39.39 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11176  normal  0.190443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1729  hypothetical protein  45.28 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.136208  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4640  hypothetical protein  40.3 
 
 		 193 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000409914  normal  0.210935 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1938  hypothetical protein  26.72 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170885  normal  0.0315238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0283  hypothetical protein  41.18 
 
 		 197 aa  43.9  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.243863  normal  0.75398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2916  hypothetical protein  36.07 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.331082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6138  hypothetical protein  34.48 
 
 		 192 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3341  hypothetical protein  38.78 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000555165  hitchhiker  0.00695747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  39.22 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1791  hypothetical protein  38.03 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.424253  hitchhiker  0.00317521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  36.21 
 
 		 204 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  45 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  45 
 
 		 199 aa  40.8  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0383  hypothetical protein  41.67 
 
 		 196 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  33.87 
 
 		 207 aa  40  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>